网易严选自营店和旗舰店的区别是认证途径、销售方式、销售渠道不同。

1、认证途径不同，自营店是指生产厂家自己经营的旗舰店，官方旗舰店指的是经生产厂家官方认可旗舰店。

2、销售方式不同，自营店就是销售平台的供货商，而官方旗舰店就是品牌方开的店铺，象征着品牌。

3、销售渠道不同，自营就是厂家卖给店家，以后店家再卖给消费者，品牌方开的旗舰店就是由厂家卖给消费者。