江苏海洋大学的校区分布涵盖了多个重要学习地点，包括苍梧、通灌、宋艞和墟沟等。

苍梧校区作为主校区，主要涵盖了理工科类的院系，例如电子信息工程、通信工程、电子科学与技术、建筑学等专业，集中于此，为学生提供全面的科技教育。

通灌校区原为连云港化工高专，之后并入江苏海洋大学，成为该校的主要校区之一，着重于人文社科类专业的教学，如汉语言文学、法学、物流管理、金融学、国际经济与贸易、市场营销学等，培养学生的文化素养与专业知识。

宋艞校区，曾是江苏盐业学校，后合并为东港学院，再改制为校区，现为职业教育学院，提供职业培训与技能教育。

墟沟校区，现集中了制药工程、药物制剂、药物分析等专业，致力于培养医药领域的专业人才。