南通地区的两所民办本科大学包括南通理工学院和南通大学杏林学院。南通理工学院，简称“通理工”，是一所经国家教育部批准的全日制普通本科高校，创建于2000年，并在2024年5月升级为本科院校。南通理工学院位于江苏省南通市，为该地区提供了优质的高等教育资源。

另一所位于南通的民办大学是南通大学杏林学院，同样为本科学校，隶属于南通大学体系，提供全面的本科教育。这两所大学均为南通地区重要的民办教育资源，满足了不同学生群体的学习需求。