【答案】：基因组DNA文库和cDNA文库的主要区别如下：

(1)构建过程不同

①基因组DNA文库

a.用限制性内切酶切割细胞的整个基因组DNA，制备大小合适的随机DNA片段。

b.将这些DNA片段与与适当的载体连接成重组子。

c.将重组子转化到细菌中，让宿主菌长成克隆，整个克隆群体包含基因组的全部基因片段总和，即成为基因组DNA文库。

②CDNA文库

a.以mRNA为模板，经反转录酶催化，在体外反转录成cDNA。

b.与适当的载体连接后转化到受体菌，使每个细菌含有一段cDNA，并能繁殖扩增，这样包含着细胞全部mRNA信息的cDNA克隆集合即为该组织细胞的cDNA文库。

(2)产生的基因结构不同

①基因组文库克隆的是所有DNA序列，包括功能未知的DNA序列;而cDNA文库克隆的是具有蛋白质产物的结构基因，包括调节基因。

②基因组文库克隆的是全部遗传信息，不受时空影响;而cDNA文库克隆的只是某段时间内被转录的DNA序列。

③基因组文库中的编码基因包括内含子和外显子;而cDNA克隆的基因不含内含子。

(3)应用范围不同

①基因组DNA文库可用于分离特定的基因片断、分析特定基因结构、研究基因表达调控，还可用于全基因组物理图谱的构建和全基因组序列测定。

②cDNA文库可用于筛选目的基因、大规模测序、基因芯片杂交等功能基因组学研究。