个人认为因为剧情设定的关系长门即使再对轮回眼的理解加深，也打不过后期有各种能力加成的宇智波斑，下面具体说明一下。

剧情中看起来能力强大的长门实际上天赋一般，其能力得到大幅度提升是在持有轮回眼之后。

长门能够得到轮回眼移植是由于其自身特殊的漩涡一族体质对于外道魔像的适应性不错，但是从二人的设定来看长门在天赋方面和宇智波斑差距还是很明显的，宇智波斑即使没有轮回眼，在佐助成长起来之前同样也是宇智波一族的第一人，无论是对于忍术的学习速度还是体术格斗能力，幻术能力天赋都不错。

而长门的话虽然在成为自来也徒弟以后迅速掌握五种属性的忍术技能，但是实际上是得到轮回眼以后的附加能力，再加上火影中的常规设定：

特殊瞳术原配在能力方面基本能够碾压后续非原配持有者，例如卡卡西在对于写轮眼的能力运用上上就比不过带土。

而且宇智波的身体内融合了千手柱间和自己的查克拉引出类似六道仙人的查克拉，这些东西都是长门没有的，因此无论长门再怎么努力，对于轮回眼的掌握程度依旧很难超过宇智波斑。

后期剧情中宇智波斑的能力又得到大幅度提升，而长门基本上是原地踏步，因此还是很难对宇智波构成威胁。

火影后期由于战斗力设定崩溃，宇智波斑作为最终决战之前的小BOSS在能力方面同样得到了提升，除了前面就拥有的轮回眼加柱间细胞能力，宇智波斑还成为了十尾人柱力，得到了真正接近六道仙人的力量，而长门后期在能力方面并没有得到提升。

因此在技能搭配方面同样属于劣势，而斑的特殊技能轮墓也是在其成为十尾人柱力以后开始使用的，长门就没有成为过十尾人柱力，因此其轮回眼也不可能开启轮墓和其它轮回眼高级技能的使用方法。

客观来说就是长门能够使用的轮回眼能力宇智波斑作为眼睛的原持有者本来就能够使用，但是后续例如求道玉，仙法，以及轮墓这些东西长门即使再努力也学不会。造成的结果就是宇智波斑依旧能够在技能配置和能力上压制长门，因此长门单纯利用轮回眼的基础能力想要打赢宇智波斑基本上是不可能的。

宇智波斑复活以后能力还能够得到提升，因此可以使用很多轮回眼的专属技能，但是后期的长门再设定方面还是为此在以前的水平。因此从技能配置来说长门属于原地踏步很难和宇智波不对抗。

最后总结一下，个人认为由于剧情发展需要的原因，长门在能力提升幅度上是比不过斑的，宇智波斑在死前就融合了柱间细胞能够使用木遁，后续成为十尾人柱力各方面能力大幅度强化，而长门的能力体系基本上还是老样子，因此想要打赢宇智波斑的概率很低，分析不到位地方请见谅，各位有其他想法欢迎留言讨论。