性质不同、基本任务不同。

根据查询知了好学显示。

1、性质不同：学生会是在学校党委领导下、团委指导下的主要学生组织；团总支是中国共青团的总支部委员会，是在党委和共青团团委领导下的青年团总支部委员会。

2、基本任务不同：学生会主要是用于维护校纪校规、倡导好的学风、校风，组织同学们开展各种有益的活动等；团总支主要是用于主持召开团支部书记会议，传达党总支和上级的精神和决议，同时也可向党总支和上级反映情况、汇报工作等。