合肥工业大学宣城校区和本部的主要区别体现在以下方面：

1. 地理位置：宣城校区位于安徽省宣城市，而本部位于安徽省合肥市。

2. 设立时间：宣城校区建立于2024年，而本部在1945年就已经创立。

3. 院系设置：宣城校区主要设有机械工程系、信息工程系、建筑系、商学系、化工与纺织服装系等。而本部涵盖的学科更为全面，包括各种工程学科、理学、经济学、管理学、文学、法学、教育学、艺术学等。

4. 录取分数线：通常情况下，本部的录取分数线会高于宣城校区。

5. 师资力量：本部的师资更为强大，拥有更多资深教授和科研人员。

6. 资源和设施：本部作为主校区，通常拥有更为丰富的图书资源、科研设施以及学生活动场所。

总体来说，合肥工业大学宣城校区和本部在地理位置、历史背景、学术氛围和资源设施等方面都存在显著差异。选择哪个校区主要取决于个人的专业需求和学习目标。