贵州省思南中学创建于1904年4月,在当时全国废除科举制度、各地兴办新学的背景下创办,时名为“思南府官立中学堂”。
1905年,校址移入凤仪书院(今实验小学)。
1932年,学校开始招生,4月23日正式开学(后将此日定为该校纪念日),是年秋,学校名称由省统一规定,更名为“贵州省立第七中学”。
1936年,因未设高中部,故更名为贵州省立“南初级中学”。
1941年,增设高中部,复改为“贵州省立思南学校”。
1950年,铜仁地区专员公署将“印江县立初级中学”、“思南县立初级中学”与省中合并,定名为“贵州省思南中学校”。
1951年,正式被省政府定名为“贵州省思南中学”。
1960年,被省政府确定为省级重点中学(全省6所)。
1980年,该校再次被省政府确定为省级重点中学(全省26所)。
1999年,被省政府确定为“贵州省现代教育技术实验学校”和“贵州省首批计算机工程学校”。
2002年1月15日,被贵州省教育厅确定为全省首批“省级示范性普通高中。