1、监管机构不同：新三板由全国中小企业股份转让系统运营有限责任公司负责监管，而老三板则由全国中小企业股份转让系统有限责任公司（即新三板的前身）和中国证券登记结算公司共同监管。

2、准入门槛不同：相较于老三板，新三板的准入门槛更低。新三板只要求企业注册地在中国大陆境内、具有独立法人资格、无重大违法记录、发行人及其控制人不存在被列入失信被执行人名单等条件即可申请挂牌。而老三板则对企业规模、经营年限、盈利能力等方面都有严格的要求。

3、融资方式不同：在融资方式上，新三板一般采用做市商报价撮合交易方式，投资者可以通过做市商低价买进高价卖出。而老三板则采用集合竞价交易方式，投资者需要在指定时间内提交报价单并等待撮合成交。