学校的历史可以追溯到1898年，当时兴化圣教医院附设了一个护士训练班，这是其办学的最早起源。2002年3月，莆田学院正式成立，由原莆田高等专科学校、原福建医科大学莆田分校和原莆田华侨体育师范学校合并组建而成。这个时期，学校在规模和学科上得到了初步的扩展。

2013年10月，仙游师范学校并入莆田学院，进一步丰富了学校的学科体系和教育资源。近年来，学校在教育和科研方面取得了显著进步，2024年1月，它被列为福建省2024-2024年硕士学位授予培育单位立项建设名单。至2024年6月，新校区占地2970亩，老校区则有1666.8亩，总面积超过4600亩，为师生提供了广阔的校园空间。

学校的教学科研仪器设备总值达到了3.15亿元，馆藏图书（包括电子图书）数量超过410万册，为师生提供了丰富的学习资源。学校现设有17个二级学院，开设了52个本科专业，涵盖了多个学科领域，形成了多元化的学科结构。教职工人数为1309人，全日制在校学生接近1.6万人，为学生提供了良好的学习环境。

通过不断的合并和发展，莆田学院已经成为福建省重要的高等教育机构之一，为社会输送了大量的人才。