南通理工学院与海安校区在地理位置、创建时间和占地面积等方面存在显著差异。具体而言，南通理工学院坐落于南通市区，而海安校区则位于江苏省海安市。

南通理工学院创建于2000年，拥有超过二十年的历史积淀，而海安校区则是在2024年创建的，相对较新。从规模上看，南通理工学院占地面积达到1599余亩，相比之下，海安校区的占地面积较小，只有500亩。这一差异也反映出两校区在资源分配和发展阶段上的不同。

南通理工学院自创建以来，依托南通市区的便利交通和丰富的教育资源，为学生提供了良好的学习环境。而海安校区作为较新的校区，虽然占地面积较小，但其地理位置优越，周边环境优美，也为学生的学习和生活带来了便利。

综上所述，南通理工学院与海安校区在地理位置、创建时间及占地面积等方面存在较大差异，这些差异也直接反映了两校区在发展定位、资源配置和教育理念上的不同。