南京大学金陵学院更好。

南京大学金陵学院和南京理工大学紫金学院都是各自所属的高等教育机构，但它们在办学背景、教学质量等方面存在一些差异。以下是

南京大学金陵学院作为南京大学的一个独立学院，拥有悠久的历史和深厚的学术积淀。它继承了南京大学的优良传统，师资力量雄厚，科研实力强劲。在教学质量和学术研究方面，南京大学金陵学院一直保持着较高的水平，为学生提供了广泛的专业选择和良好的学术氛围。

南京理工大学紫金学院则是一所以理工科为主的高等教育机构，它依托南京理工大学的优质教育资源，具有较强的工科专业优势。该学院注重实践教学和校企合作，为学生提供了丰富的实践机会和就业前景。

两所学院都有自己的优势和特点。但如果从整体的办学实力和学术声誉方面来看，南京大学金陵学院在学科建设、师资力量、科研实力等方面更具优势。因此，可以说南京大学金陵学院在整体上更好。

当然，选择哪所学院还要根据个人的兴趣、专业需求和职业规划等因素进行综合考虑。每所学院都有自己的特色和优势，选择适合自己的学院才是最重要的。