福建工程学院目前拥有五个校区，分别是旗山（大学城）、仓山、浦东、鳝溪以及软件园校区。每个校区都承载着学校不同的教育使命，为学生提供丰富的学习和生活环境。

旗山校区位于福建省福州市大学新区学园路3号，它不仅是学校的主要教学区，也是各类学术活动的中心。仓山校区则坐落于福建省福州市晋安区鼓山镇浦东路1号，该校区以其优美的校园环境和完善的教学设施吸引着众多师生。

浦东校区同样位于福建省福州市晋安区，其地址是浦东路1号，这里是一个适合科研和实践学习的地方。鳝溪校区则坐落在福建省福州市晋安区鳝溪学园路9号，也就是福州东三环路附近，它为学生提供了便捷的交通条件。

软件园校区是学校近年来发展的一个新校区，位于软件园区内，专注于信息技术和软件开发领域的教育和研究，为学生提供了先进的学习和实践平台。

这五个校区各具特色，不仅满足了学校多样化的教学需求，也促进了学校与地方经济、文化的深度融合，为地方经济发展贡献力量。