三江学院东校区与三江学院在创办时间上有明显差异，东校区成立于2002年，而三江学院则创办于1992年。这标志着东校区成立相对较晚。

在高等教育层次上，东校区与继续教育学院采用统一管理模式，主要为高等职业教育，培养本专科学生，其定位为高职院校。而三江学院，作为经国家教育部批准的省属普通本科高校，是江苏省第一家民办本科普通高校，并且是全国最早的四所民办本科高校之一，属于本科教育层次。

简称为识别标识，东校区以其高等职业教育背景，简称为“三高职校”，而三江学院则以其综合性和本科属性，简称为“三江”。这反映了两校区在教育侧重点和学生群体定位上的差异。

在专业与院系设置上，东校区专业主要包括市场营销、计算机科学与技术、电气工程及其自动化、广告学、旅游管理、财务管理、会计学、数控技术、电子信息工程技术等。尽管这些专业覆盖了多个领域，但其数量和范围相较于三江学院来说相对较少，这可能反映了东校区在专业设置上的精细化和针对性。