山东理工职业学院王牌专业涵盖多个领域，包括光伏发电技术与应用、机电一体化技术、汽车检测与维修技术、物流管理等。学院的特色专业还包括旅游管理、会计电算化。下文详细列出了学院各校区的专业开设情况。

济宁校区开设有光电工程学院的专业包括应用电子技术（光伏材料加工与应用技术方向）、电气自动化（光伏发电技术及应用方向）、光伏应用工程；软件工程学院设有软件技术、计算机应用技术、计算机网络技术、信息安全技术及物联网应用技术；航空学院提供高铁乘务、航海机电设备维修、航海乘务等课程；航海学院则有航空机电设备维修、航空服务工程等专业；汽车工程学院包括汽车检测与维修技术、新能源汽车技术、汽车智能技术、智能网联汽车技术、汽车技术服务与营销、城市轨道车辆应用技术；化工新材料工程学院开设煤炭深加工与利用、应用化工技术、宝玉石鉴定与加工技术等课程；知识产权学院提供知识产权专业；国际教育学院设有会计（中澳合作专升硕）；继续教育学院提供其他专业。

兖州校区设有中德智能制造学院；云澳航空国际学院；轨道交通学院。

鱼台校区专业包括机电工程学院的机电一体化技术、数控技术、机械制造及自动化、无人机应用技术、工业机器人技术；能源与材料工程学院开设光伏工程技术、光伏材料制备技术、电气自动化技术、应用化工技术、药品生产技术、环境工程技术；商学院提供市场营销、电子商务、物流管理、酒店管理、旅游管理、国际贸易、报关与国际货代、会展策划与管理；中医康养康育学院则有中医康复技术专业；信息工程学院设有软件技术、计算机应用技术、计算机网络技术、物联网应用技术、虚拟现实及人工智能；建筑工程学院包括装潢艺术设计、工程造价、建筑工程技术、视觉传播设计与制作、环境艺术设计；金融会计学院提供会计计算化、财务管理、投资理财课程；文化旅游与艺术学院开设旅游管理、酒店管理、旅游管理（高铁乘务方向）；孔子文化旅游管理学院提供五年一贯制高职课程。