这两个铁路的区别在于地理位置不同、列车类型不同、服务功能不同。

1、地理位置不同：深圳北站位于深圳市龙华区，是一个新建的车站，也被称为新深圳站或深圳新客站。深圳站位于深圳市罗湖区，紧邻罗湖口岸，是广深铁路的南端起点，也被称为罗湖火车站。

2、列车类型不同：深圳北站停靠的全是以g或d开头的动车高铁。深圳站主要发车的是以k、t和c开头的广深和谐号动车组。

3、服务功能不同：深圳北站是广深港高铁的重要车站，服务于高速铁路线路。深圳站是深圳铁路枢纽的重要组成部分，是中国铁路的大型口岸车站之一。