《倾世皇妃》大结局中，馥雅最终选择了祈佑，两人历经坎坷后终于在一起了。

在剧情的最后阶段，馥雅面临着艰难的选择。她深爱的两个男人，祈佑和连城，都为她付出了巨大的牺牲。祈佑为了她放弃了皇位，而连城则为了救她而身受重伤。在这样的情境下，馥雅的选择显得尤为重要和艰难。

她最终选择了祈佑，这个决定并非一蹴而就，而是经过深思熟虑的结果。馥雅与祈佑之间的感情深厚，他们共同经历了许多风风雨雨，这种亲密无间的感情基础是她做出选择的重要因素。此外，祈佑为了她所做出的牺牲也让她深感愧疚和感动，她希望能够用自己的爱来回报他。

在大结局中，馥雅和祈佑一起离开了皇宫，开始了他们的新生活。这个结局虽然简单，但却充满了温馨和希望。它向观众传达了一个信息：无论经历了多少困难和挫折，真爱始终能够战胜一切。馥雅和祈佑的爱情故事也因此成为了一个永恒的传说，感动了无数观众的心弦。

总的来说，《倾世皇妃》的大结局是一个关于爱情、牺牲和希望的感人故事。它通过馥雅的选择，展现了人性的复杂和伟大，也让观众对真爱有了更深刻的理解和感悟。这个结局不仅符合剧情的发展逻辑，也满足了观众对美好爱情的期待和向往。