山西中医药大学有太原校区和晋中校区，太原校区位于山西省太原市晋祠路一段89号；晋中校区位于山西省高校园区大学街121号。

山西中医药大学的前身为1978年创办的山西医学院中医大学班，1989年经原国家教委批准成立山西中医学院，2024年5月经教育部批准更名为山西中医药大学。

2001年开始招收硕士研究生，是山西省人民政府与国家中医药管理局共建高校、教育部首批卓越医生（中医）教育培养计划改革试点高校、推荐优秀应届本科毕业生免试攻读研究生高校。