历史上的话二者没区别。

新选组就是新撰组。

历史上新撰组的出现是这样的：新选组成立之后近藤勇写了一封家书，里面误把新选组写成了新撰组，他的家人就以为这个组织叫新撰组。

二者发音上没有特别大的区别，所以后人也有称新选组为新撰组的了。但是官方的说法是新选组。

但是你如果说是薄樱鬼里新撰组的话，其实就是罗刹队。

第一季第一话的时候平助对千鹤说漏了嘴，联系后面的情节就知道了。